שמואל לא התלהב מהמועמדות הזו בגלל האופי הפוליטי של התפקיד ובנוסף מזכירות הקיבוץ לא אישרה לשחרר אותו והציעה לו את תפקיד מזכיר הקיבוץ. כך היה לו קל לוותר על התפקיד ולכהן כמזכיר הקיבוץ. תפקיד אותו מילא פעמיים במהלך השנים.
כשהציעו לו את התפקיד בפעם השלישית הוא ביקש להיות גזבר הקיבוץ.
במשך השנים מילא שמואל תפקידים רבים בקיבוץ ומטעם הקיבוץ. מכיוון שהיה לו ניסיון בנוטרות שימש במשך תקופה ארוכה שומר שדות. לאחר מכן גם מזכיר פנים, חבר בועדת חברים, ועדת בית הכנסת, ועדת דירות וחבר בוועד בית הספר. כמו כן, גם עבד בהנהלת החשבונות של טירת צבי, והתפקיד אותו מילא בהתנדבות במשך עשרות שנים מפעיל התחנה המטאורולוגית של טירת צבי.
במשך השנים מילא תפקידים במסגרת מזכירות הקיבוץ הדתי, יסד את ועדת הבטחון בקיבוץ הדתי שבמסגרתה הוזמן לישיבות עם הרמטכ"ל וטיפל בבני המשקים הדתיים שגויסו לצה"ל.
פנינה היתה מרכזת קניות ושהתה בחיפה במשך השבוע דבר שהוביל לכך ששניהם נעדרו מהקיבוץ לא מעט בתקופות מסוימות. כמו כל הילדים, גם ילדיהם גדלו בבית הילדים. מבחינתו של שמואל הדבר לא היה ענין אידיאולוגי אלא צו השעה. חברי הקיבוץ היו עסוקים מאוד בעבודה ובבטחון ואך טבעי שהילדים יטופלו על ידי הקיבוץ.
